DNase I(RNase-free)
● 产品组成:
货号
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名称
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规格
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RTT2104-01
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DNase
I (RNase-free) 1 U/μl
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200 U
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RTT2104-02
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10×DNase
Reaction Buffer
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0.2 ml
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RTT2104-03
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10×EDTA终止液(25
mM)
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0.2 ml
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-
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RNase-free水
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1 ml
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● 保存: -20℃贮存,有效期一年。
● 产品简介:
DNase I,即Deoxyribonuclease
I,中文名称为脱氧核糖核酸酶I,是一种可以消化单链或双链DNA产生单脱氧核苷酸或单链或双链的寡脱氧核苷酸的核酸内切酶。DNase
I水解单链或双链DNA后的产物,5'端为磷酸基团,3'端为羟基。 DNase I活性依赖于钙离子,并能被镁离子或二价锰离子激活。镁离子存在条件下,
DNase I可随机剪切双链DNA的任意位点;二价锰离子存在条件下,DNase
I 可在同一位点剪切DNA双链,形成平末端,或1-2个核苷酸突出的粘末端。该DNase I不含RNase
(RNase free),可以用于各种RNA样品的处理。提供了用于DNase I失活所需的EDTA。
用途:制备不含DNA的RNA样品;RT-PCR反应前RNA样品中去除基因组DNA等可能的DNA污染;体外T7, T3, SP6等RNA
Polymerases催化的RNA转录后去除DNA模板;DNase
I footprinting研究DNA-蛋白质相互作用;缺口平移(nick
translatioin);产生DNA随机片段文库;细胞凋亡TUNEL检测中部分剪切基因组DNA作为阳性对照。
● 活性定义:
One unit of
the enzyme completely degrades 1 μg of DNA in 10 min at37°C.
● DNaseI贮存缓冲液:
50mM
Tris-acetate (pH7.5),10mM CaCl2,50% (v/v) glycerol
10×DNase Reaction Buffer:100m M Tris-HCl (pH7.5 at 25oC),25mM MgCl2,1mM CaCl2
● DNaseI失活或抑制:
加入EDTA至终浓度为2.5mM后,65℃加热10分钟可使DNase I失活。酚氯仿抽提也可以使DNase I失活。金属离子螯合剂,达到毫摩尔/升浓度的锌离子,0.1%的SDS,DTT、巯基乙醇等还原剂,50-100mM以上盐浓度均对DNase I有显著抑制作用。
● 使用方法:
一 RT-PCR反应前RNA样品中DNA的去除:
1.在RNase-free离心管中加入以下溶液:
组份
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10μl反应体系
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备注
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RNA溶液
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1-3
μg
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RNA加入体积小于8
μl
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10×DNase Reaction
Buffer
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1
μl
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DNase I (RNase-free) 1 U/μl
|
1
μl
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RNase-free水
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补至10μl
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轻柔混匀
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2.
37oC
孵育
30 分钟。
3.
向上述反应体系中加入
1μl 10×EDTA终止液,65oC
孵育
10 分钟以失活
DNase I。
注:在没有鏊合剂如
EDTA存在情况下加热,RNA
可被水解。
4.
RNA样品即可直接用作RT-PCR反应的模板。
二 体外RNA反转录后模板DNA的去除:
1. 在每含有0.5 μg模板DNA的反转录反应体系中加入1U DNase I。
注:在某些情况下,模板DNA完全消化所需的DNase的量需通过实验进行摸索。
2. 37oC
孵育15分钟。
3. 酚/氯仿抽提失活DNase I。
三 体外RNA反转录后模板DNA的去除:
1. 参考如下表格设置反应体系:
组份
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体积
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10×Reaction
Buffer for DNA Polymerase I
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2.5
μl
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3
dNTP Mixture (1mM each, without the
labeled dNTP) *
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1.25
μl
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[α-32P]-dNTP,
~110TBq/mmol (3000Ci/mmol)
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1.85-3.7MBq
(50-100μCi)
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DNase
I (freshly diluted to 0.002U/μl)**
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1
μl
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DNA
Polymerase I, E.coli
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0.
5-1.5 μl (5-15 U)
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Template
DNA
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0.25μg
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RNase-free水
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至25μl
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*3
dNTP Mixture (1mM each, without the
labeled dNTP):分别取不含已经标记的 dNTP 外的 3 种 dNTP(100mM) 各 1μl 加入到 97 μl 的RNase-free水中混匀即可。例如标记的为
dATP,则需混合
dTTP、dCTP
和
dGTP 三种
dNTP 至每种的最终浓度为
1 mM。配制好的
dNTP 可存放于-20oC
以备后续使用。
**DNase
I 可以用
1X Reaction Buffer for DNA Polymerase I 进行稀释。
10×Reaction
Buffer for DNA Polymerase I:500mM Tris-HCl (pH7.5 at 25oC),100mM
MgCl2,10mM DTT。
2.
立即
15oC 孵育
15~60 分钟。
3.
上述反应体系中加入1
μl of 0.5M EDTA(pH 8.0)终止反应。
4.
从中取出少量例如1
μl 检测标记效率。通常标记效率至少可以达到
108cpm/μg DNA。