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单链DNA Marker(20-75 nt)预混型

单链DNA Marker(20-75 nt)预混型

产品编号:RTM501

产品规格:25次

数量
价格 ¥500

单链DNA Marker20-75 nt预混型                

 

货号

名称

规格

RTM501

单链DNA Marker20-75 nt)预混型

25

 

● 产品编号及规格:

货号

名称

规格

贮存

RTM501-01

单链DNA Marker20-75 nt)预混型

25次(125 μl

-20℃

DL080-01

2×TBE尿素上样缓冲液

1 ml

4℃-20℃

● 产品简介:

单链DNA Marker由不同长度的单链DNA分子混合而成,7条带的大小为20,25,30,35,40, 50,75 nt。35 nt 浓度约为100 ng/μl,其余条带浓度约为50 ng/μl。该产品已经含有上样缓冲液,使用前70度处理5分钟后可以直接上样。该Marker适用于跑尿素变性胶,电泳后使用单链DNA PAGE电泳染色试剂盒(Cat:RTS5103),核酸PAGE电泳染色试剂盒(Cat:RTS5102),核酸快速高灵敏度染色试剂盒(Cat:RTS5101)或核酸染料如RealSafe Red(货号:GR002)或RealSafe All(货号:GR004)均可以得到清晰的条带分离效果。

产品内附带2×TBE尿素上样缓冲液(Cat:DL080-01),方便待检样品的上样。以每次上样5 μl计算,该产品可以使用大约25次。

●  保存条件和运输:

-20℃贮存;有效期2年;湿冰运输。

● 使用方法:

注:以下使用方法均以8×10cm凝胶 1.0mm示例,其他规格凝胶请适当调整。

. 凝胶制备:

1.1 可以选择DNA尿素PAGE电泳试剂盒(Cat:RTE4102))或按照以下程序制胶:

表一 TBE-尿素PAGE分离胶配方表 (总体积5 ml,适用于厚度1.0 mm小板胶)

单链DNA长度

最佳凝胶浓度

尿素(克)

40%PAA

29:1

10×TBE

补水到总体积

10%APS

TEMED

200-1000 nt

5%

2.1

0.625 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

50-400 nt

8%

2.1

1 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

30-300 nt

10%

2.1

1.25 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

10-150 nt

15%

2.1

1.875 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

5-120 nt

20%

2.1

2.5 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

 1.2在凝胶模具中灌入适量分离胶溶液(对于mini-gel,凝胶液加至约距前玻璃板顶端1.5 cm或距梳齿约0.5 cm即可),然后在分离胶溶液上轻轻覆盖一层1-5 cm的水层,使凝胶表面保持平整。

1.3静置10-20分钟,待分离胶和水层之间出现一个清晰的界面后,说明凝胶已聚合。

注:凝胶的聚合时间与环境温度有关。夏天温度较高时,聚合较快;冬天气温低时,聚合时间会延长。可以根据环境温度的不同调节APS的加入量。

1.4去除覆盖在分离胶上的水层;按照表二将不同体积成分在一个小烧杯中混合;最后加入10%过硫酸铵和TEMED,轻轻搅拌使其混匀,避免产生气泡。

表二 TBE-尿素PAGE 4%浓缩配方表 (总体积2 ml,适用于1.0mm厚度胶)

各组份体积(ml

凝胶浓度

尿素

40%PAA29:1

10×TBE

灭菌水

10%APS

TEMED

4%

0.84

0.2 ml

0.2 ml

补水至体积2 ml

20 μl

2 μl

1.5将浓缩胶溶液加至分离胶的上面,直至凝胶溶液到达前玻璃板的顶端;将梳子插入凝胶内,避免产生气泡。

1.6静置30-60分钟,等待浓缩胶聚合。

注:凝胶的聚合时间与环境温度有关。夏天温度较高时,聚合较快;冬天气温低时,聚合时间会延长。可以根据环境温度的不同调节APS的加入量。

. 样品制备:

2.1 取适量体积单链DNA Marker样品(不用添加上样缓冲液);待测样品与等体积的2×TBE尿素上样缓冲液(Cat:DL080-01)混合,70℃处理5分钟,冰浴制冷后待上样。

.电泳:

3.1. 预电泳(可选):电泳槽内外加入适量1×TBE缓冲液稳压200V预电泳30分钟。电泳结束后,1×TBE缓冲液彻底冲洗加样孔2-3次,去除残余的尿素

3.2.上样:根据梳齿确定Marker上样量, 一般是10齿1mm厚梳子上样5 μl,15齿1mm厚梳子上样3 μl。

3.3. 连接电源线,打开电源开关,按照以下条件电泳。

 

恒电压

起始电流

结束电流

电泳时间

适用条件

推荐电压

200 V

15-20 mA/板胶

10-15 mA/板胶

60+ min

最佳电压,最优的分辨率


3.4. 等待上样缓冲液的溴酚蓝指示前沿到凝胶底部时终止电泳,取出凝胶进行后续实验。

变性胶浓度

溴酚蓝

二甲苯菁

5%

35 nt

130 nt

8%

19 nt

75 nt

10%

15 nt

55 nt

15%

10 nt

52 nt

20%

8 nt

35 nt

四.染色:

用单链DNA PAGE电泳染色试剂盒(Cat:RTS5103),核酸PAGE电泳染色试剂盒(Cat:RTS5102)或核酸快速高灵敏度染色试剂盒(Cat:RTS5101)染色均可以得到清晰的条带分离效果。注:如果使用核酸染料染色,RealSafe Red(货号:GR002)或RealSafe All(货号:GR004)核酸染料结合单链核酸效果最佳,强烈建议使用以便获得最佳效果的胶图。其余染料如GelRed,Goldview,EB等染色效果不好。

● 注意事项:

1. 单链DNA Marker产品适用于变性PAGE垂直电泳,不适用于水平琼脂糖凝胶电泳。


● 电泳示例:

1. 使用单链DNA PAGE电泳染色试剂盒(货号:RTS5103)染色:


2. 使用核酸PAGE电泳染色试剂盒(货号:RTS5102)染色:

3. 使用RealSafe Red核酸染料(货号:GR002)染色:


4. 使用核酸快速高灵敏度染色试剂盒(货号:RTS5101)染色


 

 

使用RTM501 单链DNA Marker20-75 nt发表部分文章列表:

 

1. [2021 IF=3.532] Real-time detection of SARS-CoV-2 in clinical samples via ultrafast ligation-dependent RNA transcription amplification

Marker :RTM501,单链DNA Marker(20-75 nt)

Author: Peng Zhang, Yang Li, Dongmei Zhang, Xinghao Zhu, Jinling Guo, Cuiping Ma and Chao Shi

Journal: Analytical Methods 2023, 15,1915

Institution Qingdao University

Paper linkhttps://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2023/AY/D3AY00093A

 


 
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